1、在1組中央空調系統中，只使用1臺規格合適的臭氧發生器，就能滿足該空調系統范圍內全部車間的消毒要求，因而臭氧消毒機的投資成本較低。
　　
　　2、利用中央空調凈化系統（HVAC）對潔凈區進行消毒在制藥廠，一般說，潔凈區面積較大，多用中央空調凈化系統完成對各潔凈區的凈化消毒。其方法是將藥廠臭氧發生器直接安裝在中央空調凈化系統的送、回風主管道中或凈化空調箱內中效過濾器后端，電源控制箱置于機房內。
　　
　　3、消毒時關閉約90%的新風進口閥門和對外排放閥門，使HVAC系統與潔凈區形成內循環狀態。每日做空氣滅菌只需開機1~1.5小時左右，代替化學試劑熏蒸蒸作大消毒也只需2~2.5小時。
　　
　　空調型臭氧消毒機：有分外置和內置式,臭氧機結合中央空調使用，利用空調的風力，將臭氧通過空調風道輸送到需要消毒的車間內。這類臭氧消毒機使用方便，臭氧投送距離遠，臭氧分布均勻度高，達到很好的殺菌效果.